Μάθημα : Opencourse Βιοπληροφορική
Κωδικός : ICTE102
-
Θεματικές Ενότητες
-
Εισαγωγή στην βιοπληροφορική
-
Βασικοί βιολογικοί όροι
-
Ηλεκτρονική διαχείριση βιολογικών δεδομένων
-
Πίνακες αντικατάστασης & οπτική σύγκριση αλληλουχιών
-
Πίνακες αντικατάστασης BLOSUM και οπτική σύγκριση αλληλουχιών
-
Σύγκριση αλληλουχιών
-
Πολλαπλή στοίχιση αλληλουχιών
-
Φυλογενετική ανάλυση
-
Κατασκευή φυλογενετικών δέντρων
-
Ευρετικοί αλγόριθμοι σύγκρισης αλληλουχιών
-
Εισαγωγή στην βιοπληροφορική
Πίνακες αντικατάστασης & οπτική σύγκριση αλληλουχιών
- Σύγκριση αλληλουχιών (DNA, RNA, proteins) κατά ζεύγη.
- Βασικές πράξεις μετασχηματισμού αλληλουχιών (Ένθεση Διαγραφή Αντικατάσταση).
- Στοίχιση αλληλουχιών με κενά.
- Ολική και τοπική στοίχιση.
- Συστήματα βαθμονόμησης για σύγκριση DNA και πρωτεϊνών.
- Αντικαταστάσεις αμινοξέων.
- Πίνακες αντικατάστασης PAM.
Έγγραφα
Διάλεξη 04.pdf Πολυμέσα
Πίνακες αντικατάστασης και οπτική σύγκριση αλληλουχιών Σύγκριση αλληλουχιών (DNA, RNA, proteins) κατά ζεύγη. Βασικές πράξεις μετασχηματισμού αλληλουχιών (Ένθεση Διαγραφή Αντικατάσταση). Στοίχιση αλληλουχιών με κενά. Ολική και τοπική στοίχιση. Συστήματα βαθμονόμησης για σύγκριση DNA και πρωτεϊνών. Αντικαταστάσεις αμινοξέων. Πίνακες αντικατάστασης PAM.