Σύγκριση αλληλουχιών

Μέθοδοι στοίχισης:

1.Οπτικοί.

2.Με αλγόριθμους δυναμικού προγραμματισμού.

3.Με ευρετικούς αλγόριθμους, που βασίζονται στην έννοια των «λέξεων».